在台灣扁柏屬的植物有台灣扁柏及紅檜兩種,一般通稱為檜木。
台灣扁柏的分布高度通常略比紅檜木高,生長的地域比紅檜木潮濕,且其生長的植被土壤發育較好。宜蘭的棲蘭山區是目前世界上面積最大的扁柏林。
紅檜是台灣最古老的樹木,在台灣的針葉樹神木裏大都為紅檜,如阿里山、溪頭、檜山、北大武山、新竹司馬庫斯及鎮西堡神木都是紅檜樹種。台灣原有大量的原始紅檜林,從日據時代開始,經數十年的砍伐,蓄積量已大量減少,目前僅在較僻遠地區有原始林的生長。
台灣扁柏、台灣紅檜主要分布於海拔1,500~ 2,500公尺之間的中海拔山區,除了以純林的方式存在外,也常常會彼此混合生長形成混交林。以族群數量來說,北台灣以扁柏居多,南台灣則以紅檜為主,在中台灣地區則兩者數量相當。
目前台灣僅存的兩處檜木天然林(北部棲蘭山、南部大武山)的樹種,棲蘭山以扁柏為主,而大武山自然保育區的檜木林則以紅檜為主要樹種,所以有「北扁柏、南紅檜」之說。
台灣扁柏又稱黃檜、厚殼仔、Hinoki,是柏科扁柏屬大喬木,雌雄同株。其濃郁的精油香氣是使台灣精油在世界芳療界發光。
毬果球形,徑9-10㎜,果鱗8-10片,種鱗木質,盾形;種子兩側有翅,翅幾與種子同寬。
黃檜的種子